白蓮教徒接下滿(mǎn)清大臣納蘭元述(甄子丹)所下的對(duì)付革命黨人的命令后,在廣州街頭借“扶清滅洋”的口號(hào)大肆搗亂洋人的使館、教堂等地盤(pán),甚至連小學(xué)生也不放過(guò),他們的舉動(dòng)令黃飛鴻(李連杰)、十三姨(關(guān)之琳)與梁寬(莫少聰)異常氣憤?! ≡谀硞€(gè)醫(yī)學(xué)會(huì)議上,黃飛鴻與革命黨領(lǐng)袖孫文(張鐵林)一見(jiàn)如故,發(fā)現(xiàn)革命黨人對(duì)救國(guó)更具遠(yuǎn)見(jiàn)時(shí),他決定幫助革命黨人逃過(guò)厄運(yùn)。隨后,他直搗白蓮教總壇決勝九宮真人,揭開(kāi)迷信假像,又因奮慨國(guó)運(yùn)衰竭民智末開(kāi),不惜與納蘭元述決一死戰(zhàn)。